Application web conviviale pour l’analyse des données du microbiome – Easy 16S

Détail

    • Structure INRAE Transfert
    • TRL (Technology readiness level) 9
    • Nom Stéphanie LEMAIRE
    • Téléphone 0624038653
    • Email stephanie.lemaire@inrae.fr

Technologie

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    • Titre Application web conviviale pour l’analyse des données du microbiome – Easy 16S
    • Description - Une interface « user-friendly »
      Easy16S est une application web interactive et intuitive, conçue pour faciliter l’exploration, la visualisation et l’analyse des données métagénomiques. Basée sur le puissant package phyloseq et ses extensions, Easy16S s’intègre parfaitement à la suite d’analyse de séquences FROGS, offrant ainsi une solution complète et optimisée. Son interface facilite la visualisation des variables d’intérêt sur la structuration des communautés microbiennes.

      - Rapidité de l’analyse
      L’application s’adresse aussi bien aux débutants qu’aux experts, désireux de visualiser rapidement des motifs et tendances au sein de leurs données, ainsi qu’aux apprenants lors de sessions de formation. En 2024, l’application Easy16S a été utilisée plus de 4 500 fois.

      - Synergie avec les outils bioinformatique INRAE
      L’outil est adossé à d’autres outils de bioinformatique issus des projets INRAE, tels que DeepOmics pour permettre une analyse simple et exhaustive de vos données.
    • Bénéfices Caractéristiques techniques :
      Application Web R-Shiny
      Compatible R ≥ 4.1
      Licence GNU Affero GPL v3.0
    • Nouveauté En savoir plus :

      1. Le site web de documentation https://easy16s.migale.inrae.fr/
      2. L’application https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S
      3. Le dépôt https://forgemia.inra.fr/migale/easy16s
      4. La publication scientifique https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.06704e
    • Mots clés PROSE – Métadonnées – Microbiome – Communauté microbienne – Application user-friendly – Shiny
    • Secteurs Chimie, Matériaux & Produits alimentaires Energie & Systèmes électriques Environnement & Construction Mesures & Instrumentation Santé STIC Application web interactive pour visualiser, explorer et analyser facilement les données de métabarcoding